Die Haubenmeise ist stark an Nadelwälder gebunden und bevorzugt bei uns Kiefernwälder, lebt aber auch gelegentlich in Mischwäldern. Im Gebirge brütet sie bis in Höhen um 1900 m, zieht sich aber im Winter in Lagen unterhalb von 1600 m zurück. Haubenmeisen wählen für den Nestbau meist enge Höhlen in Bäumen oder Baumstüpfen, die das Weibchen, sofern das Holz morsch ist, noch erweitert.

Brut: April - Juni, 5 - 8 Eier
Brutzeit 13 - 15 Tage, Nestlingszeit 17 - 21 Tage

Das Weibchen brütet allein, wird während dieser Zeit aber oft vom Männchen gefüttert. Die Jungen werden von beiden Partnern versorgt.